Der Träger des Lukas-Krankenhauses Bünde ist der gemeinnützige Verein Evangelisches Krankenhaus Bünde.

Da dieser Verein vor der Verkündung des BGB gegründet wurde, hat er nicht die Rechtsform eines eingetragenen Vereins ("e.V."), sondern die Rechte einer juristischen Person wurden ihm durch landesherrliche Verordnung verliehen, nämlich am 4. Dezember 1899 durch Kaiser Wilhelm II.

Damit fand eine diakonische Initiative Bünder Bürger ihre formelle Anerkennung. Der Krankenhausbetrieb wurde am 22. Oktober 1890 mit der Aufnahme des ersten Patienten (eines Tippelbruders aus Dänemark) begonnen und kann nunmehr auf eine mehr als 100-jährige Geschichte zurückblicken.

Gemäß seiner diakonischen Orientierung ist das Lukas-Krankenhaus Mitglied im Diakonischen Werk der evangelischen Kirche von Westfalen und Gründungsmitglied des Valeo-Verbundes, einer Kooperation von Evangelischen Kliniken in Westfalen.